Группа была основана в 1990 ударником и гитаристом Джеспером Стрёмбладом как сайд-проект его основной группы Ceremonial Oath.
В 1993 он покидает группу и сосредотачивается на In Flames. К нему присоединились гитарист Гленн Люнгстрём и басист Йохан Ларссен, сформировав первый состав группы. Стрёмблад попросил Микаэля Станне, ритм-гитариста группы Dark Tranquillity, записать вокал для демо In Flames. Кроме того к группе временно присоединился гитарист Карл Нёсланд. Этот состав и записал песни для Demo '93, которое произвело хорошее впечатление на компанию Wrong Again Records. Тем же составом в декабре 1993 они выпустили на этом лейбле дебютный альбом Lunar Strain. Станне не мог продолжать участвовать в группе, поскольку был занят в Dark Tranquillity, где также взял на себя обязанности вокалиста после ухода Андерса Фридена в Ceremonial Oath.

После успешного первого альбома Стрёмблад занялся вплотную поиском вокалиста и ударника. В 1994 году группа записала ряд песен, вокальные партии на которых исполнили Henke Forss (Dawn), Jocke Gothberg (Marduk),

Robert Dahne, Per Gyllenbäck. Результатом этих записей стал мини-альбом Subterranean.
В 1995 году Ceremonial Oath прекращает свое существование и Стрёмблад приглашает на место вокалиста Андерса Фридена. Место за ударными занял Бьёрн Гелотте. В новом составе осенью 1995 In Flames записывает второй альбом The Jester Race, который увидел свет летом следующего года, обложку к нему делал Андреас Маршалл.
Продюсером группы, начиная с этого альбома, стал Фредерик Нордстрём. В поддержку альбома группа провела тур с группами Dimmu Borgir, Samael и Kreator.

Этим альбомом они привлекли внимание как в Европе так и в Японии, получив контракт с японским лейблом Toys Factory. Быстро растущая популярность In Flames и многочисленные гастроли позволили группе подписать новый контракт с крупнейшим немецким метал лейблом Nuclear Blast. Затем в феврале 1997 года был выпущен мини-CD

«Black-Ash Inheritance», предварявший выход большого альбома. Таким образом в 1997 году In Flames выпускает подряд мини «Black-Ash Inheritance» и полный альбом Whoracle, который выдержан в стиле «The Jester Race».

Параллельно Еспер вместе с Оскаром Дроньяком создал пауэр-метал группу HammerFall, где играл на ударных. Туда же перешли Гленн Люнгстрём и Йохан Ларссен, а вокалистом первое время был всё тот же Станне. С 1993 по

1997 годы составы HammerFall и In Flames практически совпадали. Однако после записи дебютного альбома Еспер покинул HammerFall и сосредоточился на работе в In Flames, где теперь играл только как гитарист, найдя постоянного ударника.
С 1997 года состав заметно поменялся. Ударные стал играть Даниэль Свенсон, новым басистом стал Петер Иверс. В этом составе был записан альбом Colony и последующие — с 1998 состав больше не менялся. Группа завоевала известность среди поклонников тяжёлой музыки, провела успешный тур по США и Японии.

In Flames (2007 год)
Называется дата 6 августа 2001 года, как дата релиза первого концертного альбома группы «Live in Japan».

Концертный альбом «The Tokyo Showdown» был записан в ходе турне в Японию в 2000 году, проводившегося в поддержку альбома «Clayman». В одном только 2000 году In Flames отыграли более 150 шоу, прежде чем в следующем засели за написание песен для этого самого альбома. Японский журнал «Burrn! Magazine» признал
Еспера лучшим композитором года.

Весной 2002 года они уже в студии и записывают очередной альбом «Reroute to Remain». Дело было в Dug-Out Studio в г. Упсала в Швеции с продюсером Даниэлем Бергстрандом (Daniel Bergstrand). Альбом вышел в сентябре — 2-го в Европе, 3-го — в США. В июле 2002 года было снято также видео для композиции «Cloud Connected».

В 2004 году в Швеции In Flames завоевала награду P3 Guld Award Show в номинации «Лучший альбом 2004 года».

В январе 2007 года In Flames получили национальную премию «Грэмми» в Швеции в категории «Best Hard Rock» за альбом «Come Clarity» (Nuclear Blast) на церемонии в зале Hovet в Стокгольме.

В феврале 2010 группу покинул основатель, гитарист Еспер Стрёмблад. С 2009 года он лечится от алкоголизма в реабилитационной клинике.

В январе 2011 было объявлено, что In Flames выступят на Sonisphere Festival в городе Knebworth, а также на

Mayhem Festival 2011 наряду с такими метал-группами, как Trivium, Machine Head, Megadeth, Godsmack, и Disturbed.

24 января 2011 года стало известно, что группа закончила запись своего нового альбома, выход которого, по предварительным данным, ожидается в мае-июне этого же года. Предварительное название альбома — «Sounds Of A

Playground Fading».
28 февраля на официальной странице группы в сети Facebook, так же как и на официальной странице Inflames.com, было опубликовано, что свободное после ухода Еспера Стрёмблада место в коллективе занял бывший гитарист группы Engel Niclas Engelin

В марте 2011 группа подписала контракт с немецкой звукозаписывающей компанией Century Media Records.
6 апреля командой было объявлено о названии и дате выхода сингла с грядущего альбома. Песня получила название «Deliver Us» и вышла 6 мая, а 20 мая вышло видео на этот сингл, причем в свободном доступе и формате 720p. Релиз же самого альбома был намечен на 15 июня в Швеции и 20 июня в остальных европейских странах. Альбом получил название Sounds of a Playground Fading. Для него было записано
ринадцать песен. Запись проходила в собственной студии группы в Гетеборге со звукоинженером Роберто Лаги. 6 июня, за 9 дней до выхода альбома в свет, произошла утечка — все песни альбома «Sounds of a playground fading» можно найти в интернете с качеством mp3 192 kbs.

В апреле 2011 года Иверс и Гелотте совместно занялись бизнесом, открыв в своём родном городе ресторан. Ресторан получил свое название в честь альбома Rush «2112»

В ноябре 2011 года выходит одноименный клип и сингл «Where The Dead Ships Dwell», в записи которого принимали участие немецкий рэппер Каспер (Casper), драм-н-бэсс группа THE QEMISTS и Кристоф Батори (Kristof

Bathory), вокалист блэк-металлического состава DAWN OF ASHES. В том же ноябре выходит EP «8 songs», содержащая в себе, помимо известных хитов с альбома «Sounds of a playground fading» и концертных записей прошлых лет, композиции — «Discover Me Like Emptiness» и «Our Infinite Struggle», выходившие ранее бонус-треками к альбомам группы.