«Раскол» — один из самых дорогих проектов российского телевидения, его бюджет может превысить $10 млн. Размер сметы объясняется в значительной степени широкой географией съёмок. Большое внимание уделяется достоверности исторической декораций и костюмов, качеству грима.
Съемки фильма начались в октябре 2009 года на «Мосфильме». Там были созданы декорации Грановитой и Крестовой палат, царские покои, патриаршие палаты. За ними последовали съёмки в усадьбе Коломенское.
В феврале съёмки проходили в Ярославской области. Так, Ростовский кремль послужил декорацией кремля Московского, а церковь Иоанна Богослова на Ишне в селе Богослов отлично подошла для создания образа XVII века.
В марте и апреле съёмки проходили в Кандалакше. На берегу Кандалакшского залива на Монастырском наволоке были созданы декорации исчезнувшего города Пустозёрска, где в земляной тюрьме протопоп Аввакум провёл 14 лет. В районе населённого пункта Белое Море снимались Мезень и Тобольск. От съёмок в настоящем Пустозёрске пришлось отказаться — следов города почти не осталось, а добираться туда сложно.
В конце апреля съёмки велись в Кирилло-Белозерском и Ферапонтовом монастырях в Вологодской области, где много лет провёл в ссылке патриарх Никон.
В мае съёмочная группа возвращалась в Кандалакшу, потом снимали в Кеми, на Соловках, в Ростове.
Съёмочный период завершился в Суздальском районе. В июне — августе 2010 года рядом с селом Абакумлево снимали деревянную Москву с Кремлём и Успенским собором, на берегу Нерли — приезд Никона в Троице-Сергееву Лавру.
После этого начался монтаж и озвучивание. Первоначально планировалось, что премьера состоится на телеканале Россия-1 в апреле 2011 года. К этому сроку работы над фильмом были завершены, но к июлю 2011 года фильм всё ещё не был показан.
Выпущено: Россия, кинокомпания Аврора при участии студии Эталон